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AAARF Genomic Repeat Investigation
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एएएआरएफ, पर्ल में लिखा गया है और कई समायोज्य मापदंडों के साथ, छोटे शॉटगन अनुक्रम डेटासेट में अनुक्रम ओवरलैप की पहचान करता है और जीनोम में सबसे प्रचुर मात्रा में दोहराता का प्रतिनिधित्व करने वाले लंबे छद्म अणुओं को बनाने के लिए उन्हें बाहर चलता है।