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BoulderALE
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बोल्डरले एक आरएनए अलाइनमेंट एडिटर है, जो माध्यमिक संरचना को देखते हुए दृश्यों और आधार संरचना के 2D प्रदर्शन के साथ-साथ बेसपेयर के एनोटेशन, एनोटेशन और सुविधाओं (क्षैतिज) और दृश्यों (ऊर्ध्वाधर) के टूटने की अनुमति देता है।