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क्यूआईपी सीआईपी-एसईक्यू ("क्रोमेटिन इम्यूनोप्रिपिटेशन ऑन सीक्वेंसिंग एंड कोट;) डेटा का विश्लेषण करने के लिए एक सॉफ्टवेयर पैकेज है। यह मनमाने ढंग से लंबाई के समृद्ध क्षेत्रों पाता है और इसलिए विशेष रूप से हिस्टोन के निशान या बहुलक के ChIP-seq का विश्लेषण करने के लिए अनुकूल है ।