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संरेखण प्रोटीन दृश्यों के अनुक्रम संरेखण की गणना और हेरफेर के लिए एक सी + + पुस्तकालय है। अधिकांश कार्यों और वर्गों को अजगर को निर्यात किया जाता है इस प्रकार जटिल कार्यों की आसान पटकथा की अनुमति दी जाती है।