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बीडब्ल्यूए एक बड़े संदर्भ जीनोम (जैसे मानव जीनोम) के खिलाफ अनुक्रमण पढ़ता है संरेखित करने के लिए एक कार्यक्रम है। यह दो प्रमुख घटक है, एक पढ़ने के लिए 150bp से कम और दूसरे के लिए लंबे समय तक पढ़ता है ।