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क्रिस्टलसीएमपी क्रिस्टल संरचनाओं की तुलना के लिए एक कोड है। यह इस उद्देश्य के लिए दो दृष्टिकोणों का उपयोग कर रहा है - फिंगरप्रिंट और आरएमएसडी दृष्टिकोण। तुलना का परिणाम एक समानता मैट्रिक्स और/या dendogram है ।