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di-बेस के लिए फास्ट अलाइनमेंट सर्च टूल पढ़ता है (रंग-स्थान; एबी सोलिड) । लोकप्रिय इलुमिना के लिए एक पूरक कार्यक्रम ने मैपर्स एमआरफास्ट और मिसेजफास्ट को पढ़ा।