ज़ेन कार्ट के लिए स्टोर मैनेजर त्वरित और कुशल ज़ेन कार्ट स्टोर प्रबंधन के लिए एक डेस्कटॉप एप्लिकेशन है। आप अपने उत्पादों, श्रेणियों और निर्माताओं को जोड़ सकते हैं, हटा सकते हैं और अपडेट कर सकते हैं, उत्पादों, श्रेणियों, निर्माताओं, दृश्य रिपोर्ट, ऑर्डर, निर्यात उत्पादों, बैकअप/पुनर्स्थापित डेटाबेस को संपादित करते समय स्वचालित रूप से अपनी उत्पाद छवियों को अपलोड कर सकते हैं, कई स्टोरों का प्रबंधन कर सकते हैं। यह सब आपके डेस्कटॉप कंप्यूटर से है। ज़ेन कार्ट के लिए स्टोर मैनेजर को डिफ़ॉल्ट एडमिन वेब इंटरफेस की कार्यक्षमता बढ़ाने, नई सुविधाओं को लाने, नियमित कार्यों को स्वचालित करने और रोजमर्रा के संचालन को सरल बनाने के लिए डिज़ाइन किया गया था। ज़ेन कार्ट के लिए स्टोर मैनेजर की मदद से आप अपनी श्रेणियों, उत्पादों, निर्माताओं को बना और प्रबंधित कर सकते हैं; अपनी बिक्री पर रिपोर्ट बनाएं, ग्राहकों को जोड़ें या प्रबंधित करें, ग्राहकों के ऑर्डर ट्रैक करें। इसके अलावा आप श्रेणियों, उत्पादों, ग्राहकों, .csv और .xml प्रारूपों की फाइलों में आदेश निर्यात कर सकते हैं। ज़ेन कार्ट के लिए स्टोर प्रबंधक स्थापना और उपयोग में एक आसान डेस्कटॉप एप्लिकेशन है। इसे चलाना आपको कुछ विकल्पों का चयन करना होगा जैसे: शॉर्टकट बनाने के लिए या नहीं, प्लगइन्स और रिपोर्ट टूल आदि स्थापित करने के लिए - मूल रूप से, आपको आगे कुछ बार क्लिक करना होगा। इस प्रकार, इसे चलाने के लिए किसी विशेष तकनीकी ज्ञान की आवश्यकता नहीं है और आप अपने ई-कॉमर्स विचारों को लागू करने पर ध्यान केंद्रित कर सकते हैं।
